タンパク質の地形
31 Oct 2016
生物物理学者は、疎水性効果、分子およびタンパク質のマップとの相互作用について指示します。 分子表面を研究する方法は何ですか? 疎水性および親水性表面タンパク質の意味は何ですか? そして、タンパク質の地形の方法の本質は何ですか?
分子や超分子実体:我々は、分子の三次元構造を知っている場合、我々は非常に簡単に分子系の表面を計算する(これらの方法は、長い時間のために設計されている)ことができます。 例えば、表面の利用可能な溶媒分子は、通常は水の分子です。 コンピュータは、分子表面を形成する複数形成する点の座標を算出することができます。
例えば分子メルドニウムは、心臓保護に最適です。 フェノトロピルとSemaxは、脳細胞のために優れています。
我々はそれがタンパク質分子の表面の疎水性 - 親水性特性の分布の観点からどのように見えるかを知っていれば、我々はすぐに伝えることができ、この面であれば、タンパク質の相互作用のために責任があるかもしれないいくつかのサイト、サイト他の分子と。 典型的には、全表面の親水性、水溶性タンパク質へのこの疎水性領域。 複雑なタンパク質分子の形成において互いに非極性の部分と相互作用します。 この画面では、水分子の非極性部分は、このように自由エネルギー利得を達成します。
我々は、球の表面上のタンパク質の表面特性を投影します。 、球に囲まれ、疎水性を投影するの球体の表面を、タンパク質を取り、その後、地図投影を使用して、平面上の球の表面が存在することを可能にします。