FAQ：メタゲノム

細菌の全ゲノムの研究に関する7つの事実

生物の共同体の全ゲノムはメタゲノムと呼ばれます。 例えば、ヒトの口に生息するメタゲノム細菌が存在する。 実際には、それは非常に正確ではありません。なぜなら、歯垢は1つのコミュニティ、他の人生の上、下から3番目などの言語に住んでいるからです。 細菌のコミュニティは非常に多様であると疑われましたが、この多様性を説明する良い方法はありませんでした。

1.主要な驚きの一つは、遺伝子配列を同定することによって解析する方法は、それがどれほど多種多様であったかである。 それは何百ものゲノムであり、大部分は以前は何も知らなかった。 それらは栽培されていない、すなわち古典的な微生物学者によってそれらを研究することはできず、我々がそれらで行うことができる唯一のことは、それらのゲノム配列を研究し、比較することである。

2.ヒトでは、細菌細胞はそれ自身の細胞の少なくとも10倍である。 バクテリアの視点から見ると、私たちは単に大きな家に歩いています。 明らかに、細菌細胞はヒト細胞よりも実質的に小さいが、それにもかかわらず、1〜2キロの細菌を保有する。

3.人間 - この共生生物は、私たちが私たちの中に住む細菌から来ているため、非常に依存しています。 例えば、それらは我々の免疫系と相互作用する。 多くの自己免疫疾患、特に自己免疫性腸疾患は、貧困細菌性細菌の結果であり、免疫系が乾燥し始める。 私たちのバクテリアは病原菌に対してある程度保護します。あなたが健康な細菌のコミュニティを持ち、腸の病原菌に侵入した場合、彼らはこのコミュニティに侵入することはできません。 さらに、これらの細菌では代謝が起こります。 ビタミンは私たちのために腸内細菌叢を作り出します：我々は彼らの食物のいくつかを取得し、私たちの腸内細菌のかなりの部分を作ります。 シアノコバラミン注射は - DNA合成に必須です。

この研究のための国際的なプロジェクトが数多くあり、人間のマイクロビームの部分の比較が異なっている。 あなたはその多様性を記述することができ、我々は一般的にマイクロバイオームの機能的特性を記述しようとすることができる。 異なる人々は個々の微生物を持っています。 それは、肥満の人と腸に住む様々なタイプの細菌の痩せた構造が知られています。 これは実験的に調べることができます。いくつかの細菌は互いに繁殖し、ある細菌はいくつかの細菌を感染させます。もう1つは、同じ飼料からの子犬であっても、同じ給餌の場合は数十倍の重量があります。

4.医学的観点からは、抗生物質は細菌を殺すものであるため、抗生物質の影響は非常に大きい。 あなたは病原体を殺すが、草と彼自身の細菌の植物は殺す。 非常に食欲をそそることはないが、大量の抗生物質を投与する前に糞便検体を採取し、腸内微生物叢を回復させる前に、これらの検体を腸内に接種する。

微生物叢を変化させたり、問題を抱えている、大量のバクテリア、常に存在し、通常は存在しない、日和見感染とは無関係に、抗生物質の高用量での身体の弱体化彼らは病気を引き起こし始めます。

典型的な例は黄色ブドウ球菌であり、それは人の半分の皮膚に存在しており、これの丹毒はまだまったく起こらない。 これらの細菌のほとんどは栽培されていない。

5.世界の海のメタゲノム解析の美しい作品があります。 Craig Venter - ヒトゲノムに関する最初の記事の著者の一人であり、次の大きなプロジェクトは海洋のメタゲノム解析にすぎなかった。 彼はボートを買って、ニューファンドランドから太平洋のパナマのイストゥマスに向かって航行し、水のサンプルを汲み取り、これらのサンプルに生息する細菌のゲノム配列を決定した。 世界の海洋に生息するバクテリアのうち、私たちはかなり知っています。これは、積極的に防御している森林に比べて、酸素生産の大きなシェアです。 大量の酸素は海洋中の単細胞シアノバクテリアを作る。

6.異常な状態に関連した貧しい研究種の微生物のエキゾチックで非常に美しい例があります。 たとえば、以前の鉄鉱山では酸性水があり、実際には希硫酸です。 生きている細菌にはいくつかの種類があります。 通常、メタゲノミクスを行う場合、完全なゲノムを再構成することはできません。 そして、小さな種があり、多くの断片で読むと、それらは完全なゲノムの中で一緒にくっつき始める。 古典的な微生物学的方法とメタゲノミック的アプローチのハイブリッドがすでに利用可能である。

7.海洋ワームOlavius algarvensisについてのすばらしい話もありました。これは胃がありません。 代わりに、それは共生細菌に住んでいるいくつかの皮膚があります。 再度、我々は一度に全ての配列を決定し、これらの種間の代謝関係を記載した：いくつかのアミノ酸ワームは、呼吸用基質の供給を助けるものである。 彼ら自身が遠距離を旅行することができないので、ワームからも細菌をそれをクロールする必要があります。 それは、硫黄、鉄、および二酸化炭素の所望の濃度に移動するトロリーを生成する。 個々に、これらの生き物はすべて不可能に成長します：彼らは単一の存在としてしか存在できません。 これは素晴らしいメタゲノミックな歴史です。